Le contrat vise la réalisation de services dans le cadre d’un projet de recherche qui comporte deux aspects principaux :
-Le premier nécessite la synthèse de librairies à partir d’ADN génomique provenant de 1000 échantillons de champignons, présentant ou non une résistance à divers agents antifongiques. Ces librairies de courts fragments seront par la suite séquencées avec un séquençage de type 2 x 150 paire de bases (pb) à haut débit avec la technologie Illumina.
-Le second aspect du projet nécessite le séquençage de librairies de fragments d’ADN issus d’une étape de capture de séquences réalisée à partir d’échantillons cliniques. Le but est de confirmer la présence ou non d’un agent pathogène fongique dans l’échantillon, d’identifier le pathogène en question si présent et de déterminer s’il y a un risque potentiel de résistance à des agents antifongiques. Le séquençage (de type 2 x 300 pb pour un total de 500 à 600 millions de lectures) à haut débit sera aussi utilisé pour cet aspect du projet.